Câu chuyện được kể dựa theo lời của nhân vật chính là cô bé Bảo Ngọc – là một cô gái thông minh, xinh đẹp, đáng yêu. Cô không phải là một con người bình thường mà là một pháp sư. Vì gia đình ngăn cấm nên cha mẹ cô đã quyết định bỏ trốn đến thế giới loài người. Sau đó họ đã sinh hạ hai cô con gái xinh xắn dễ thương là Bảo Ngọc và chị gái Nguyễn Ánh Dương. Nói là sinh đôi nhưng thật ra tính cách họ khác nhau hoàn toàn. Bảo Ngọc năng động bao nhiêu thì Ánh Dương lãnh đạm bấy nhiêu. Cô cũng có thêm 3 người bạn thân nữa và họ cũng là pháp sư giống cô.
Tất cả họ đều đang chuẩn bị chuyển đến ngôi trường Huyền Diệu để được dạy dỗ về pháp thuật, và đặc biệt là thực hiện nhiệm vụ tìm kiếm hậu duệ của công chúa ánh sáng. Bên cạnh những câu chuyện kì thú, huyền ảo về thế giới phép thuật, là câu chuyện tình yêu gặp phải muôn vàn khó khăn của Bảo Ngọc và anh chàng Hạo Phong.
Liệu những người bạn của chúng ta có thực hiện được nhiệm vụ được giao? Liệu ngôi trường Huyền Diệu này có thật sự có những bí ẩn diệu huyền như chính cái tên của nó. Tất cả câu trả lời đều nằm trong bộ truyện này. Truyện teen Bí Ẩn Ngôi Trường Huyền Diệu là truyện cực kỳ hấp dẫn và lý thú, truyện với nội dung đặc sắc và cách xây dựng nhân vật cũng đầy sáng tạo pha lẫn sự hài hước, mang lại tiếng cười vui nhộn cho độc giả.