Truyện Bí Mật Của Tomoko là tựa truyện huyền bí, thú vị và mới lạ thuộc thể loại xuyên không. Câu chuyện xoay quanh nhân vật tên Tomoko, cô phải xuyên qua một thế giới khác vì một sự cố bất ngờ. Thời điểm kiếp trước, Tomoko chưa bao giờ nghĩ đến những chuyện bi quan mặc dù cô là một cô nhi nhưng lại sống một cách lạc quan, vui vẻ và đôi lúc mặt cô hơi dày. Có lẽ chính vì sự nhàm chán nên ông trời đã tặng cho cô một bất ngờ vô cùng lớn, đó là cô sẽ được sống lại ở thế giới mới. Ở nơi này cô phải cố gắng vượt qua tất cả những biến cố uy hiếp đến sự sống của bản thân và người nhà. Nhưng cũng chính vì những biến cố đó mà cô đã gặp được những người không thể thiếu trong cuộc sống sau này của mình.
Vậy cô nên lo lắng hay cảm thấy may mắn đây? Một người từ lúc bé đến lớn, cả 2 đều xem đối phương là người mình cần bảo vệ. Một người xông ngang cô cuộc sống nhưng để lại dấu vết không chút nào nhỏ. Một người khi thiếu niên khinh cuồng, mang trong mình mục tiêu duy nhất, cho đến bóng hình cô đơn nhưng gặp cô làm cuộc sống của hắn muôn màu, muôn sắc. Một người tâm tư sâu nặng, phúc hắc vì gặp cô mà biến lúng túng, không biết làm sao. Một người vốn đã tưởng trong cơ thể đều in đậm sự tàn nhẫn, mỗi lần gặp cô là một lần nhân nhượng ra điểm giới hạn của mình cho đến. Một người mang lên Pocker Face khi mỗi lần hành động vì gặp cô mà tất cả sinh biến, bởi tất cả điểm yếu trên người hắn nhưng đều nằm trong tay cô, kể cả thứ quan trọng nhất.